Study: Gut metagenome in European women with normal, impaired and diabetic glucose control

Publication: Karlsson et al., Gut metagenome in European women with normal, impaired and diabetic glucose control (2013, Nature)

External link: SPIRE database (MAGs, genes and proteins including annotations)

Study accession: PRJEB1786

Last annotation change: 2025-09-29

Human Metadata

11.7
 4
12.3
 4
10.1
 3
10.5
 3

CD163

89%
1004
 1
1006.04
 1
1007.16
 1
1033.03
 1

CRP_mg_L

100%
0.69
 4
0.34
 2
0.49
 2
0.71
 2

CRP_mg_dl

100%
69
 4
0.09
 2
0.19
 2
115
 2

C_peptide

100%
2.1021
 6
1.83183
 4
2.13213
 4
2.43243
 4
5.39
 3
5.41
 3
5.49
 3
5.73
 3
72
 11
69
 10
64
 8
59
 7
n
139
Y
 6
n
93
Y
 52

FGF_19

89%
100.14
 1
100.46
 1
100.73
 1
102.69
 1
0.4
 18
0
 17
0.2
 16
0.1
 14

GLP_1

89%
0.1
 20
0.24
 2
0.3
 2
0.31
 2

G_GT_U_L

100%
0.28
 7
0.29
 7
0.36
 6
0.24
 5
5.8
 10
5.3
 8
5.7
 8
5.9
 8

HDL_mg_dl

100%
40.7692
 4
60
 4
51.1538
 3
54.6154
 3

HDL_mmol_L

100%
1.06
 4
1.56
 4
1.33
 3
1.42
 3

HbA1c

100%
5.3525
 16
5.5355
 16
5.627
 16
5.444
 14
35
 16
37
 16
38
 16
36
 14

IL_1

89%
0
98
0.63
 2
0.1
 1
0.14
 1
12
 8
11
 7
10
 6
13
 5

LDL_mg_dl

100%
108.846
 3
110
 3
111.538
 3
121.154
 3

LDL_mmol_L

100%
2.26
 3
2.49
 3
2.83
 3
2.86
 3

Leptin

99%
10.9
 2
12.2
 2
12.5
 2
14.1
 2
n
123
Metformin
 20
Sulph
 2
112
 1
118
 1
121
 1
126
 1

TNFalpha

100%
0.81
 3
1.58
 3
1.6
 3
1.76
 3
1.03
 4
0.55
 3
0.71
 3
0.78
 3

WC

100%
92
 11
94
 9
80
 8
85
 8

WHR

100%
0.87
 14
0.84
 13
0.86
 13
0.89
 9
38
 2
39
 2
40
 2
15
 1
112
 1
118
 1
121
 1
126
 1

Sample alias Spire sample name Longitude Latitude Geographic location Location resolution Collection date Collection date end Last change Tax id Environment material Environment biome Environmental package Environment feature Artificial Pmid Doi